长江三峡工程是治理和开发长江的关键性骨干工程，具有防洪、发电、航运和水资源利用等巨大综合效益，在枢纽总体布置和枢纽工程、工程建设和生态环境保护、工程运行管理等方面取得了一系列重大创新突破。

我院自上世纪30年代就组织开展长江三峡开发初步计划相关科研工作。长期以来，我院在三峡工程枢纽工程布置、高水头船闸水力学、坝区与变动回水区泥沙冲淤、升船机通航安全、库区与坝下游航道综合治理、复杂地基基础处理、水工材料等方等方面开展了大量的科研工作，取得了一系列重要创新成果，为三峡工程规划、论证、设计、建设、运行等提供了有力的科技支撑。该项成果是我院获得的第二项国家科技进步特等奖。

2019年，我院已获国家和部省级各类科技奖20项，其中，国家科技进步特等奖1项，牵头完成国家科技进步二等奖1项，部省级科技奖进步特等奖5项、一等奖9项。