2017年2月10日，水利部陈雷部长在我院呈报的2016年工作总结和2017年工作要点的报告上作重要批示：“南科院2016年工作卓有成效；2017年工作思路清晰，重点突出，要全力抓好落实，推动各项工作再上新台阶。”

2月14日，陆桂华副部长在我院呈报的2016年工作总结和2017年工作要点的报告上作出批示：“请南科院认真落实陈雷部长的指示，再接再厉，不忘初心，继续前进，多出人才、多出成果，进一步提升影响力和话语权，为实现水治理体系和治理能力现代化提供强有力的科技支撑。”